در پی تصمیم فدراسیون فوتبال مبنی بر لغو برگزاری هفته‌های پایانی لیگ برتر بیست و پنجم و عدم تعیین رسمی قهرمان این دوره از رقابت‌ها، چالش‌های جدیدی در ابعاد حقوقی و مالی باشگاه استقلال ایجاد شده است.
با وجود اصرار کنفدراسیون فوتبال آسیا بر استفاده از جدول رده‌بندی لیگ برتر ایران جهت تعیین نماینده کشور در لیگ نخبگان آسیا و حضور استقلال در این رقابت‌ها، فدراسیون فوتبال همچنان از اعلام رسمی این باشگاه به عنوان قهرمان فصل بیست و پنجم خودداری می‌کند. این تصمیم که در پی عدم امکان برگزاری رقابت‌های باقی‌مانده اتخاذ شده، فراتر از بحث‌های اعتباری، پیامدهای مالی سنگینی برای برخی از بازیکنان این باشگاه به همراه خواهد داشت.
بر اساس بررسی‌های صورت گرفته، تعدادی از بازیکنان باشگاه استقلال در قراردادهای خود بندهای پاداش مربوط به «قهرمانی در لیگ برتر» و «قهرمانی در جام حذفی» را گنجانده بودند. با توجه به لغو مسابقات جام حذفی و همچنین عدم اعلام رسمی عنوان قهرمانی در لیگ برتر، این بازیکنان از دریافت مبالغ تعیین‌شده در قراردادهای خود محروم خواهند شد که این موضوع منجر به ضرر مالی قابل توجهی برای آن‌ها می‌گردد.
در حالی که این مسئله می‌تواند از نظر بودجه باشگاه مزیت محسوب شود، اما مدیران باشگاه استقلال، از جمله علی تاجرنیا، بارها نسبت به تبعات حقوقی و اعتباری عدم ثبت رسمی این قهرمانی ابراز نگرانی کرده و خواستار شفافیت در این زمینه شده‌اند.
